توضیحات
محلول حاوی phenol / Guanidine برای استخراج RNA total از نمونه های مختلف می باشد.
• برداشت بافت
نخستین مرحله از استخراج RNA است که طی آن بافت مورد نظر از میان مجموعه بافتی بدن جدا میشود که برای این منظور میتوان از پروتئازها استفاده نمود. گاهی نیز در محیط آزمایشگاه بافتهای آماده در ته فلاسک وجود دارند که برای جدا کردن آنها ازتریپسین و EDTA استفاده میشود.
• همگن سازی
در دومین گام باید RNA و دیگر اجزای سلولی را از محاصره غشایی خارج نموده که بدین منظور باید مجموعه سلولی را تخریب کرده و ترکیبی همگن بدست آورد. RNX-Plus یا Trizol در این مرحله مورد استفاده قرار میگیرند.
• جداسازی فازها
در این مرحله RNA را از DNA و پروتئینهای سلولی جدا مینمایند. پس از اضافه نمودن کلروفرم به نمونه آنرا تحت شرایط ویژهایسانتریفیوژ کرده که در پایان سه فاز تفکیک شده را حاصل مینماید. فاز زیرین مربوط به پروتئینها، فاز میانی مربوط به DNA و فاز رویین مربوط به RNA میباشد.
• رسوب سازی RNA
در این مرحله پس از انتقال فاز رویین به لولهای دیگر با استفادهایزوپروپانول و سپس سانترفیوژ RNA را رسوب میدهیم.
• شستشوی RNA
ششتشوی رسوب RNA با استفاده ازاتانول ۷۵٪ گام پنجم را تشکیل میدهد. نکته: در استخراج DNA شستشو با الکل ۷۰٪ انجام میشود ولی در استخراج RNA با الکل ۷۵٪
• محلول سازی RNA
انحلال رسوب RNA با استفاده از DEPC treated Water ششمین گام از استخراج RNA میباشد
• تجزیه و تحلیل RNA
آخرین گام سنجش صحت استخراج RNA میباشد که از دو طریقاسپکتروسکوپی یا الکتروفورز کمیت یا کیفیت کار مورد ارزیابی قرار میگیرد.
